双软企业所得税全面审核是否会有难度？

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如题，假定有一个软件企业，与当地税务协定，免除所得税，是否会构成审核障碍？

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软件企业的优惠政策：
1、增值税，按一般纳税人征税后，税负超3%的部分，实行即征即退
2、企业所得税，凡认定为高新技术企业的，按15%的税率征税；经认定的软件企业，自获利年度起，企业所得税实行"两免三减半".上述低税率和定期减免优惠由企业自主选择最优惠的执行,不能同时享受
对国家规划布局内的重点软件生产企业，如当年未享受免税优惠的，减按10％的税率征收企业所得税。
软件生产企业的工资和培训费用，可按实际发生额在计算应纳税的所得额时扣除。
3、进出品税收，对经认定的软件生产企业进口所需的自用设备，以及按照合同随设备进口的技术（含软件）及配套件、备件，不需出具确认书、不占用投资总额，除国务院国发〔1997〕37号文件规定的《外商投资项目不予免税的进口商品目录》和《国内投资项目不予免税的进口商品目录》所列商品外，免征关税和进口环节增值税。

不能和税务协商就决定，要有法律依据

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需法定减免，收支两条线，主管税务机关无权减免税收的。